Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtmaP26350 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtmaP26350 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtmaP26350 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtmaP26350 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtmaP26350 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms