Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1aP25118 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1aP25118 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms