Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18525 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18525 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18525 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P18525 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18525 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18525 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18525 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18525 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18525 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18525 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms