Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhoP15409 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhoP15409 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhoP15409 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhoP15409 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhoP15409 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RhoP15409 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhoP15409 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhoP15409 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhoP15409 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RhoP15409 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RhoP15409 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RhoP15409 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhoP15409 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoP15409 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoP15409 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms