Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NclP09405 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NclP09405 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NclP09405 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NclP09405 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NclP09405 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NclP09405 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NclP09405 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NclP09405 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NclP09405 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NclP09405 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NclP09405 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NclP09405 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NclP09405 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NclP09405 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NclP09405 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NclP09405 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NclP09405 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NclP09405 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NclP09405 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NclP09405 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NclP09405 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NclP09405 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NclP09405 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NclP09405 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NclP09405 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NclP09405 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NclP09405 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NclP09405 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NclP09405 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NclP09405 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NclP09405 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NclP09405 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NclP09405 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NclP09405 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms