Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01725 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01725 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01725 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01725 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01725 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01725 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01725 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms