Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac1O09106 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac1O09106 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms