Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx7F8VPJ6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rfx7F8VPJ6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx7F8VPJ6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms