Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
6030445D17RikE9Q8F9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms