Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsperg2C6KI89 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsperg2C6KI89 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms