Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brpf1B2RRD7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf1B2RRD7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms