Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a3A2ACT7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a3A2ACT7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms