Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700019A02RikA0A087WPV9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms