Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc1Q9QZF2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms