Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col5a3Q9JLI2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col5a3Q9JLI2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.7 ms