Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms