Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtofQ9ESF1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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