Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubiad1Q9DC60 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms