Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg8Q8VE18 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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