Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lancl3Q8CD19 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lancl3Q8CD19 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lancl3Q8CD19 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl3Q8CD19 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms