Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6820408C15RikQ8BJX2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms