Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rtl1Q7M732 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rtl1Q7M732 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rtl1Q7M732 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms