Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot1Q6ZQ08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot1Q6ZQ08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms