Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx4Q6RUU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx4Q6RUU0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms