Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flrt1Q6RKD8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Flrt1Q6RKD8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms