Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn2Q6PHP6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Lrrn2Q6PHP6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms