Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2surpQ6NV83 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2surpQ6NV83 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms