Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NipblQ6KCD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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