Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Knl1Q66JQ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms