Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mdh1bQ5F204 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdh1bQ5F204 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms