Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a2Q3ZAS0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a2Q3ZAS0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 489.3 ms