Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
4930567H17RikQ3V0K5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.4 ms