Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkain3Q3URJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkain3Q3URJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms