Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms