Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Xrn1P97789 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Xrn1P97789 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Xrn1P97789 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Xrn1P97789 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Xrn1P97789 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Xrn1P97789 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Xrn1P97789 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Xrn1P97789 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Xrn1P97789 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Xrn1P97789 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Xrn1P97789 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Xrn1P97789 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms