Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms