Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TfamP40630 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TfamP40630 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TfamP40630 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TfamP40630 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TfamP40630 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TfamP40630 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TfamP40630 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TfamP40630 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms