Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms