Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3P21107 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3P21107 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3P21107 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3P21107 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms