Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama1P19137 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama1P19137 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lama1P19137 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms