Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01725 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01725 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01725 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01725 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01725 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01725 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01725 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01725 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01725 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01725 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01725 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01725 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms