Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a4O88343 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms