Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1baO35930 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1baO35930 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms