Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabep1O35551 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabep1O35551 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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