Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf5O35326 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf5O35326 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms