Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smad7O35253 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smad7O35253 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms