Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4aF8VPX6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4aF8VPX6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4aF8VPX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4aF8VPX6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4aF8VPX6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4aF8VPX6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms