Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox13F6YCR7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox13F6YCR7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms