Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8444F6XS56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms