Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms